民50年	具有壹千功率之水池式核子反應器（原子爐）一座，完成初步臨界運轉，開始作業。一方面適應教學研究需要，一方面配合國家政策，展開原子能和平用途之推廣工作，是為我國進入原子能時代之里程碑。
民51年	5月19日梅校長病故，陳教務長可忠奉命代理校務（民54年真除）。夏，本校鑑於數學之重要與日俱增，國內大專學校數學師資至為缺乏，為培植數學研究人材，充實大專數學師資，並加強原子科學研究之數學課程，增設數學研究所。
民52年	春，數學研究所招考第一屆研究生。
民53年	政府鑑於培植科學基礎人材，適應國家發展科學教育之需要，指令本校恢復大學部，設置核子工程及數學兩學系，參加聯合招生。
民54年	增設物理學系。
民55年	增設化學系。原子科學研究所之物理組，以數年來之經營，設備漸臻充實，青年物理學家返國來校任教者，亦漸增多，乃於秋季成立物理研究所，招收第一屆研究生。
民56年	設立物理研究所博士班。
民57年	原子科學研究所化學組，亦以成立物理研究所同樣情形成立化學研究所，招收第一屆研究生。
民58年	7月陳校長可忠退休，閻振興先生繼任校長。
民59年	6月閻校長調任立台灣大學，本校校長由徐賢修先生繼任。原子科學研究所核工組改設為原子核工程研究所。
民61年	增設應用化學研究所、應用物理研究所、應用數學研究所、材料科學工程學系、工業化學研究所、工業化學系、動力機械工程學系。
民63年	增設分子生物研究所、工業工程學系及化學研究所博士班，均開始招生，並將原有所系分設三學院，即理學院、工學院及原子科學院。