根據2009年7月1日更新之基本科學指標(Essential Science Indicators，簡稱ESI）資料庫，本校生物暨生化（Biology & Biochemistry）領域首度入選成為進入世界論文被引次數前1%之學校。這是本校第六個入選領域，另外五個領域包括化學、物理、材料、工程及計算機科學。

重要的是，這是國內首度以非醫學院之大學進入生物暨生化排行榜，代表著本校在生物醫學領域進入國際水準的重要里程碑。的確，清華大學在生命科學與生物醫學的研究與教學居於國內領導地位，並且有相當良好的國際學術聲譽，有2位榮獲中央研究院院士、2位獲傑出人才講座、1位獲教育部學術獎、8位獲國科會傑出研究獎。歷屆畢業校友在生命科學研究有相當傑出的表現，近年來知名雜誌及國際權威學者針對高校教學與研究評鑑，本校生命科學領域整體表現於全國首屈一指。本校生物醫學科技研發中心及生命科學院將繼續推動引領潮流之標竿研究，以期臻至國際一流水準之研究，更能積極參與國家生醫園區之運作，開創生物醫學科技新紀元。

ESI資料庫完整蒐集歷年之論文數據，其中論文被引次數達前1%之文章數目，不僅可直接反映出論文的品質及重要程度，更是評估論文之國際影響力的基準。由於該數據資料庫，能快速提供客觀數據，作為長期追蹤學術表現之用，因此目前是國際上進行學術評量的重要指標，同時也是台灣評核國內大學論文質量表現的重要參據。

ESI統計資料蒐集過去十年(1999年1月起迄今年4月)之論文，下表為各領域數據。

	領域	世界排名	Papers	Citations	Citations Per Paper
1	CHEMISTRY	172	2,376	22,293	9.38
2	PHYSICS	292	2,261	14,853	6.57
3	MATERIALS SCIENCE	48	1,591	10,890	6.84
4	ENGINEERING	131	1,973	7,280	3.69
5	BIOLOGY & BIOCHEMISTRY	684	460	3,788	8.23
6	COMPUTER SCIENCE	203	623	1,349	2.17

另根據Thomson ESI提供資料，下圖顯示以五年為一區間，本校論文數、被引用數、每論文被引數用成長趨勢。
Citation Data (In 5-year Intervals):

5-year Intervals:	1999- 2003	2000- 2004	2001- 2005	2002- 2006	2003- 2007	2004- 2008	2005- 2009
# of Papers	4,213	4,342	4,730	5,148	5,649	5,962	6,294
Times Cited	10,672	11,700	13,394	15,264	18,514	22,456	26,337
Citations per Paper	2.53	2.69	2.83	2.97	3.28	3.77	4.18