98年全國大專校院運動會於5月6日落幕，在十二種競技項目中，本校雖僅參加其中六項，但仍以8面金牌、2面銀牌及5面銅牌的佳績，在162所參賽學校隊伍中，勇奪第8(非體育科系學校排名第3)。優異的表現，令人激賞。

這8面金牌分別來自游泳項目5面，田徑項目1面以及桌球項目的2面。其中，游泳代表隊更因此榮獲男生一般組團體冠軍錦標，創下了游泳校隊成立之後參與全大運的最高名次，同時在這5面金牌中，包括有四項刷新大會紀錄，尤其難得的是在4×200公尺自由式接力項目，更是大幅地將原紀錄往前推進了14秒之多，當場震驚了與賽所有選手。游泳教練李大麟副教授及施秉宏老師指出，校隊如此傑出的表現，確實超出賽前預期，關鍵應在於選手們充分運用課餘時間主動地加強訓練，再透過良性競爭的激勵和策略下，締造出如此優異成績。

桌球賽事同樣是精采刺激，過程更是峰迴路轉，女隊辛璧宇在先輸兩局後逆轉三局獲勝，為男、女球隊振奮出氣勢，終場女隊以三比一取勝政大，拿下女子團體項目金牌；男隊方面，在連勝三點之後，最後由博士班老將楊文呈以三比一局數擊敗逢甲的第一主力，以四比二取勝逢甲，榮獲男子團體項目金牌。至於在田徑場上，周沛瑜再繼97年100公尺跨欄項目勇奪第1名佳績後，繼續發揮實力，蟬連該項目的第1名寶座。

「全國大專校院運動會」的舉辦，除提供大專學生共同參與運動競賽的機會，亦可提倡運動風氣，提昇運動技術水準，促進學生身心健康及增進校際間情誼。有充沛的體力作後盾，才是靈活思維與卓越研究的基礎。本校學子在盡心追求學識豐博之際，並能勤於鍛練強健體魄與運動技能，為校爭光，非常值得效法與鼓勵，同時也是清華培育「多元能力人才」理念的一種落實。